Desde la restauración de la Provincia fue deseo de todos se recuperase la antigua fundación de Granada de tan gratos recuerdos para la Orden. Ya en 1921 fue aprobada en firme esta idea por el Definitorio Provincial.
En 1949 hubo una oferta a la Provincia de Sor Cristina de la Cruz, abadesa del Monasterio de Santa Paula de Sevilla, cuya familia era propietaria de los terrenos, que en otro tiempo ocupara el convento de Los Mártires. Las condiciones de la oferta aconsejaron no aprovecharla y se perdió para siempre la posibilidad de recuperar la antigua fundación, de tan gratos recuerdos Sanjuanistas.
En 1953 se iniciaron las gestiones, que por fin culminarían con éxito. Por recomendación del Definitorio se trasladó el Provincial a Granada y halló al Arzobispo D. Rafael García y García de Castro en muy buenas disposiciones. Pidió por escrito el permiso para la fundación, que le fue concedido el 17 de abril de 1954. Los trámites fueron muy rápidos y el 8 de mayo, tras la concesión por la Sagrada Congregación de Religiosos del correspondiente Rescripto, el General hacía la erección canónica.
De hecho las cosas no fueron tan rápidas. Fallaron algunos intentos de establecerse en algún lugar provisionalmente. Cuando más adelante se decidió en firme hacer aquí el Colegio Mayor para nuestros estudiantes de filosofía y teología, el P. Pablo de la Virgen del Carmen pasó a residir definitivamente a Granada, hospedándose con los Hermanos Hospitalarios de S. Juan de Dios e inició la búsqueda de terrenos apropiados. La penuria económica impidió se aprovechasen ofertas muy interesantes. En enero de 1958 se compró una finca en la Carretera de Jaén nº 84, llamada Casería de San José, y en ella se restauró el 1 de noviembre de 1959 la fundación. Iniciaron la vida regular el P. Alfredo y el Hno. Rafael (Mimbrero). Antes hubo que superar algunas dificultades de última hora surgidas con el Arzobispo, que no recordaba haber dado el permiso para la fundación. En 1960 se iniciaron gestiones para vender la Casería de San José y con su producto adquirir otros terrenos en lugar más adecuado.
Después, por amenazar ruina la Casería, estuvieron en tres pisos de la calle Doctor Olóriz y luego en otros de la Avenida de la Constitución mientras se compraba un nuevo terreno en la barriada de San Francisco, calle Polo y Caña, también cerca de la entrada a la ciudad por la carretera de Jaén, que se adquirió tras la venta de gran parte de la Casería de San José. Aquí se hizo edificio de nueva planta por el arquitecto D. José María García de Paredes con un ala de cuatro plantas, de diez celdas cada una de las tres superiores, y otra ala con dos plantas para dependencias comunes, biblioteca y capilla provisional mientras se esperaban tiempos mejores para construir una gran iglesia en parte del solar reservada para ello. Posteriormente esa parte fue reclamada para plaza pública y se dividió del resto de la propiedad mediante una calle, por lo que nuestra casa quedó sólo con lo edificado hasta el momento, aunque con una amplia zona de huerta.